Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtn3Q9ES97 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms