Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms