Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms