Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms