Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms