Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg8Q9DBM0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms