Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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