Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms