Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms