Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn22Q9D7U6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn22Q9D7U6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn22Q9D7U6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn22Q9D7U6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn22Q9D7U6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn22Q9D7U6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn22Q9D7U6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Cldn22Q9D7U6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn22Q9D7U6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Cldn22Q9D7U6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cldn22Q9D7U6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cldn22Q9D7U6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn22Q9D7U6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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