Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp5Q9D7S9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp5Q9D7S9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp5Q9D7S9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp5Q9D7S9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp5Q9D7S9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp5Q9D7S9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp5Q9D7S9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms