Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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