Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4aQ9D6F9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms