Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ribc2Q9D4Q1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ribc2Q9D4Q1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ribc2Q9D4Q1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ribc2Q9D4Q1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ribc2Q9D4Q1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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