Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcc1Q9D4H2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms