Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms