Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms