Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms