Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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