Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krtap5-3Q9D226 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms