Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sugt1Q9CX34 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms