Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Cnih4Q9CX13 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cnih4Q9CX13 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cnih4Q9CX13 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cnih4Q9CX13 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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