Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms