Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms