Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb2bQ9CWF2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms