Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Filip1Q9CS72 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms