Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms