Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms