Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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