Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms