Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brms1Q99N20 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms