Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms