Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tm2d1Q99MB3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tm2d1Q99MB3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms