Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms