Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms