Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms