Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms