Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms