Protein–RNA interactions for Protein: Q91YT2

Rnf185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf185Q91YT2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf185Q91YT2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms