Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco4Q91WU4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms