Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms