Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms