Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms