Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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