Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc137Q8R0K4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms