Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7N6

Traf3ip2, TRAF3-interacting protein 2, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip2Q8N7N6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Traf3ip2Q8N7N6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Traf3ip2Q8N7N6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Traf3ip2Q8N7N6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Traf3ip2Q8N7N6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Traf3ip2Q8N7N6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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