Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms