Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms