Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms