Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Col6a6Q8C6K9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Col6a6Q8C6K9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Col6a6Q8C6K9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Col6a6Q8C6K9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Col6a6Q8C6K9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Col6a6Q8C6K9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col6a6Q8C6K9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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